L’Assemblée Générale se tient tous les 4 ans.

Elle regroupe les délégations des Fédérations Régionales au prorata de leurs effectifs.
Lors de cette A.G., sont élus :
1 Président
1 Secrétaire Général
2 Secrétaires Généraux Adjoints
1 Vice-Président de la Production
1 Vice-Président de la Transformation
1 Vice-Président de la Distribution
1 Vice-Président des Services
1 Trésorier
1 Trésorier Adjoint.
Ces 10 personnes composent le Bureau Exécutif Restreint.

avec 7 Membres et 2 Contôleurs Financiers ,
ces personnes élues lors de l’Assemblée Générale composent le Bureau Exécutif Plénier.

Le Président, Le Secrétaire Général, les 2 Secrétaires Généraux Adjoints et le Trésorier représentent la F.N.A.A. au Comité Confédéral.

La reconnaissance du titre de Cadre est née à la fin du 19ème, début du 20ème siècle. Les Cadres n’ont pris réellement conscience de leurs intérêts qu’après les évènements sociaux de 1936.

C’est en 1937que fût créé le 1er syndicat des Cadres de l’Industrie et des Commerces de l’Agroalimentaire (SICICA). Il ne concernait que des adhérents isolés.C’est au cours de la dernière guerre, que les Cadres ont compris la nécessité de défendre leurs intérêts et ceci par profession.

En mai 1944, la branche Agroalimentaire regroupe ses sections et syndicats de province afin de créer la Fédération Nationale des Cadres et Agents de Maîtrise des Industries et Commerces Agricoles et Alimentaires et prend le sigle "F.N.C.A."

Le 15 octobre 1944, le SICICA en rejoignant d’autres syndicats de branches, fonde la C.G.C. qui est devenue depuis, la CFE-CGC.

En 1981, le Syndicat National des Cadres des Coopératives Agricoles quitte la Fédération de l’Agriculture et rejoint la F.N.C.A.

En 1985, le Syndicat des Cuirs et Peaux demande son rattachement à la F.N.C.A.

C’est également en 1985 que la Fédération des Commerces et Services (F.N.E.C.S) et la F.N.C.A. décident de fusionner et de devenir la Fédération du Personnel d’Encadrement des Industries et Productions Agroalimentaires, des Cuirs, des Commerces et Services et des Activités Annexes et devient le F.I.P.A.C.C.S.

En 1987, la F.N.C.E.S reprend son autonomie.

Courant 1990, les Syndicats des Cadres d’Exploitation (S.N.C.E.A.) et des Agents de Développement Agricole (S.N.A.D.A.) quittent à leur tour la Fédération de l’Agriculture et rejoignent la F.I.P.A.C.C.S., qui devient la Fédération du Personnel d’encadrement de la Production, de la Transformation, de la Distribution Agroalimentaire et des Cuirs et Peaux (F.N.A.A.) ou Fédération Nationale de l’Agroalimentaire.

Fin 1990 - début 1991, le Syndicat de la Mutualité Agricole (S.N.C.Mu.A.), le Syndicat des Inséminateurs (S.N.I.) ainsi que les derniers Syndicats de l’Agriculture (S.N.D.O.C.L.), (S.N.C.O.A.) et le Syndicat des Expatriés, rallient la F.N.A.A.

Depuis cette époque, la F.N.A.A. fédère :
Les Syndicats Nationaux issus de l’Agriculture,
Le Syndicat des Cuirs et Peaux,
Les Syndicats départementaux issus de l’ancienne Fédération Agroalimentaire,
Le Syndicat National des magasins "CASINO" (S.N.G.C),
Le Syndicat National des magasins "CARREFOUR" (S.N.E.C.),
Le Sydnicat National des magasins "AUCHAN" (S.E.G.A.),
Les Fédérations Régionales Agroalimentaire.